【摘 要】
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目的 通过宫颈癌(CC) mRNAs网络的差异表达分析及生存相关mRNAs的基因集富集分析,获得新的可靠的生存预测标志物.方法 下载癌症基因组图谱数据库(TCGA)中CC的mRNAs表达和生存数据,使用R3.6.2软件构建预后模型.使用GSEA 4.0.3软件对生存相关mRNAs进行基因集富集分析.结果 经多步骤回归分析构建CC患者生存预测模型.该模型的12个mRNAs均伴有不同程度的体细胞突变,C-指数=0.84,3年生存率的AUC=0.838,5年生存率的AUC=0.869.该模型风险评分提示低风险组
【机 构】
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兰州大学第一医院妇产科,甘肃兰州730000;大连医科大学基础医学院,辽宁大连116044;兰州大学第一医院妇产科,甘肃兰州730000;兰州大学第一医院甘肃省妇科肿瘤重点实验室,甘肃兰州730000
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目的 通过宫颈癌(CC) mRNAs网络的差异表达分析及生存相关mRNAs的基因集富集分析,获得新的可靠的生存预测标志物.方法 下载癌症基因组图谱数据库(TCGA)中CC的mRNAs表达和生存数据,使用R3.6.2软件构建预后模型.使用GSEA 4.0.3软件对生存相关mRNAs进行基因集富集分析.结果 经多步骤回归分析构建CC患者生存预测模型.该模型的12个mRNAs均伴有不同程度的体细胞突变,C-指数=0.84,3年生存率的AUC=0.838,5年生存率的AUC=0.869.该模型风险评分提示低风险组患者生存预后优于高风险组.经基因集富集分析显示,KRAS_ UP.V1、KRAS SIGNALING、RB_DN.V1、UV RESPONSE DN基因集分别与多个生存相关mRNAs显著相关.结论 CC患者生存预测模型可有效评估其预后风险,模型mRNAs主要通过KRAS UEV1、KRASSIGNALING、RB_DN.V1、UV RESPONSE DN途径影响患者预后,模型mRNAs、KRAS、RB、UV相关基因集有望成为CC基因靶向干预和生存预测的新靶标.
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