【摘 要】
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随着下一代生物序列测序技术的发展，大文件生物序列数据越来越常见。虽然压缩序列数据能减少数据存储空间，但是传统的数据压缩的方法很难快速完成大规模的序列压缩，因此如何缩短
【机 构】
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上海大学计算机工程与科学学院,上海众恒信息产业股份有限公司
【基金项目】
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国家自然科学基金重大研究计划项目(91330116);教育部留学回国人员科研启动基金
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随着下一代生物序列测序技术的发展，大文件生物序列数据越来越常见。虽然压缩序列数据能减少数据存储空间，但是传统的数据压缩的方法很难快速完成大规模的序列压缩，因此如何缩短数据压缩时间是当前压缩技术研究的一个重要方向。采用CUDA技术实现算术编码，分析核苷酸生物序列数据特性，给出不同物种及数据库生物序列数据集中核苷酸的分布概率，提出并比较三种并行压缩方法，指出先验概率的并行压缩方法具有更好的压缩性能。实验结果表明，先验概率的并行压缩方法不仅具有较高的时间效率，而且也能保持较高的数据压缩率，能较好地解决大规模生物
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