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目的调查海南汉族居民慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌患者中幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)babA2,cagA,vacA基因型和亚型的分布,探讨H.pylori基因型差异与临床感染结局的关系。方法从自176例胃十二指肠疾病患者的胃镜活检胃黏膜标本中分离幽门螺杆菌菌株,提取幽门螺杆菌DNA,用聚合酶链反应检测H.pylori的cagA、vacA(vacAs1/vacAs2/vacAm1/vacAm2)及babA2基因型。结果176例患者中H.pylorica-gA的阳性率72.72%(128/176);babA2 54.55%(96/176);vacAs1 73.30%(129/176);vacAm2 67.05%(118/176);va-cAs1/cagA65.34%(115/176);vacAs1/babA2 51.70%(91/176);cagA/babA2 50.00%(88/176);vacAs1/cagA/babA251.14%(90/176)。慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者中vacAs1,cagA,cagA/vacAs1基因型阳性率明显高于慢性浅表性胃炎患者(P<0.05)。其他基因型在各疾病间分布的差异无显著性(P>0.05)。结论海南汉族H.pylori感染的优势基因型为cagA,vacAsl,vacAm2,cagA/vacAs1。慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡、胃癌患者中va-cAs1、cagA、cagA/vacAs1基因型更多见。未发现babA2基因型与H.pylori临床感染结局的相关性。