【摘 要】
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目的优化DNA寡核苷酸单链退火条件,提高单链DNA寡核苷酸退火效率,加速shRNA表达载体构建速度。方法将茎环内部碱基结构不同DNA寡核苷酸链在不同浓度(50、100、150、200mmol/L
【机 构】
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哈尔滨医科大学附属第一医院骨外一科,解放军总医院骨科,军事医学科学院二所
【基金项目】
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国家自然科学基金(30672135)
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目的优化DNA寡核苷酸单链退火条件,提高单链DNA寡核苷酸退火效率,加速shRNA表达载体构建速度。方法将茎环内部碱基结构不同DNA寡核苷酸链在不同浓度(50、100、150、200mmol/L)NaCl退火缓冲液中进行退火,通过琼脂糖凝胶电泳观察DNA寡核苷酸链在退火前后电泳速度的变化,利用Gene Tools分析软件对电泳图像进行分析比较退火效率。结果当退火缓冲液中NaCl浓度为200mmol/L时,DNA寡核苷酸单链退火效率明显提高,茎环内部碱基互补的DNA寡核苷酸单链退火效率46.00%±3.33%,茎环内部碱基不互补DNA寡核苷酸单链退火效率97.00%±1.49%。结论NaCl浓度和茎环内的碱基设计是影响shRNA退火主要因素,优化shRNA的退火条件,提高退火效率,可以加速载体构建。目的优化DNA寡核苷酸单链退火条件,提高单链DNA寡核苷酸退火效率,加速shRNA表达载体构建速度。方法将茎环内部碱基结构不同DNA寡核苷酸链在不同浓度(50、100、150、200mmol/L)NaCl退火缓冲液中进行退火,通过琼脂糖凝胶电泳观察DNA寡核苷酸链在退火前后电泳速度的变化,利用GeneTools分析软件对电泳图像进行分析比较退火效率。结果当退火缓冲液中NaCl浓度为200mmol/L时,DNA寡核苷酸单链退火效率明显提高,茎环内部碱基互补的DNA寡核苷酸单链退火效率46.00%±3.33%,茎环内部碱基不互补DNA寡核苷酸单链退火效率97.00%±1.49%。结论NaCl浓度和茎环内的碱基设计是影响shRNA退火主要因素,优化shRNA的退火条件,提高退火效率,可以加速载体构建。
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