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肺炎作为儿童常见疾病及最重要的死亡原因之一,早期识别病原体对精准医疗及加速康复尤其重要。临床上常见的传统病原体检测方法包括病原分离培养、血清学抗体检测、抗原检测、聚合酶链反应技术等,由于存在培养周期长、敏感性低、容易产生假阴性结果等劣势,现已逐渐不能满足临床需求。近年来,随着宏基因组二代测序技术的出现,为明确儿童肺炎病原体提供了一种新的诊断策略,其能够检测到包含细菌、真菌、病毒在内的所有已知基因序列的病原体,具有通量高、敏感性高、检测速度快等优势。该文将对宏基因二代测序在儿童肺炎病原检测中的应用进行综述。