【摘 要】
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目的对5份疑似脑炎患者的临床脑脊液中可能存在的病原体进行检测。方法同时采用随机扩增方式与病毒序列非依赖性的病毒靶向富集技术(virus sequence independent targeted amplification，VSITA)对5份脑脊液中的病毒病原进行样本制备，然后进行宏基因组二代测序，同时分析宿主转录组。最后结合定量PCR验证所检测到的病原。此外，比较两种样本制备方法的富集效率。结果
【机 构】
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国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所，北京 102206,国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所，北京 102
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目的对5份疑似脑炎患者的临床脑脊液中可能存在的病原体进行检测。
方法同时采用随机扩增方式与病毒序列非依赖性的病毒靶向富集技术(virus sequence independent targeted amplification，VSITA)对5份脑脊液中的病毒病原进行样本制备，然后进行宏基因组二代测序，同时分析宿主转录组。最后结合定量PCR验证所检测到的病原。此外，比较两种样本制备方法的富集效率。
结果通过高通量测序结合宏基因组分析的方法在3份脑脊液样本中检出巨细胞病毒(cytomegalovirus，CMV)核酸序列，定量PCR验证为弱阳性(Ct值分别为30.23、32.83、34.8)；转录组分析后的差异基因集进行功能富集后结果提示宿主CMV感染通路(Human cytomegalovirus infection)上调(P＝0.213)。病毒靶向扩增建库的测序结果优于随机方法(P＝0.096)。
结论差异分析结果显示宿主对于CMV感染通路的表达有所提升，进一步证明了该疑似脑炎患者脑脊液中存在CMV感染。
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