文章通过对治理结构的研究,提出当前海关内部治理结构存在人员配比不合理、缺少顶层设计与制度研究团队,治理结构中传导机制不适应发展要求、直属海关承担中间层的承接作用不明显,治理结构中协作机制不健全、治理主体过于分散与风险信息的碎片化难以形成有效的协作平台,部分隶属海关下属办事处的存在不经济等问题。作者结合相关专家的研究,提出以整体治理为蓝图的解决方案,包括治理层级的整合、治理平台与运作机制的创新、专家队伍的建立。具体改革方向:扩大总署人员与职能、撤减直属海关机构、撤减隶属海关缉私分局,总署层面风险、审单、咨询答复平台的建立、人力资源管理的改革等,以期建立大总署、大现场、信息技术支撑下的内部治理结构,并建立以综合作业平台、有效人力资源管理、合理绩效考核为基础的内部治理机制。从而通过内部治理机构的改革,实现海关治理能力的提升。