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CTAB法、SDS法和改良的热硼酸法所提取的番木瓜果皮总RNA产量分别是107．8、90．4和70．4μg／g；种子总RNA产量分别是164．0、204．8和111．2μg／g。用TSSE或TE溶液溶解CTAB法中的LiCl过夜沉淀，得到的总RNA完整性好、纯度高，种子总RNA的产量明显提高，达到300μg／g以上。用CTAB法提取的果皮和种子总RNA已成功用于cDNA合成、文库构建和抑制消减杂交（SSH）等后续分子生物学试验。