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目的探讨行剖宫产术产妇阴道、肠道、胎盘及其新生儿胎便中微生物群落组成和新生儿肠道微生物的来源。方法收集2016年10月在昆明市延安医院行剖宫产术的4例产妇的肠道、阴道、胎盘样品及其新生儿胎便样品。依赖高通量测序技术对细菌16S rRNA基因进行测序,分析不同部位样品中微生物群落组成及样品之间的相关性。结果通过对不同样品含微生物可操作分类单元(OTU)数目比较,发现产妇胎盘中数目最多,其次是产妇肠道和阴道样品,新生儿胎便中最少。通过PCA聚类分析各样品,发现新生儿胎便样品受个体差异性影响最小,阴道样品受影响最大,产妇的肠道和胎盘微生物群落有一定相似性。通过比较各样品微生物群落组成,发现新生儿胎便和产妇胎盘样品中丰度最高的是变形菌门,产妇肠道和阴道样品中丰度最高的是硬壁菌门。结论剖宫产术中母系间的微生物转移传递方向可能是由产妇的肠道转移至产妇胎盘再转移至新生儿肠道。