霍乱弧菌双精氨酸转运系统基因共转录和同源性分析

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目的

研究霍乱弧菌双精氨酸转运系统(twin-arginine translocation system,Tat)基因簇各个基因的共转录情况,并确定参与Tat转录基因簇构成。

方法

选择霍乱弧菌埃尔托生物型菌株N16961和tatABC基因缺失株N169-dtat进行Tat基因簇及上下游基因,即上游蛋白质生物合成ubi aarF基因和下游细胞色素C551过氧化物酶编码基因cyt551基因进行逆转录,分析Tat基因簇的共转录情况。选择霍乱弧菌及其他弧菌属菌株,通过PCR产物测序和序列比对,对Tat转运系统的同源性进行比较,进行Tat基因簇各基因聚类分析。

结果

Tat基因簇4个基因(tatAtatBtatCtatE)均可以共转录。ubi aarF基因可以与tatAtatB共转录。cyt551基因与上游的4个基因均不共转录;通过N16961 Tat基因缺失株总RNA逆转录分析发现,虽然ubi aarFtatAtatB的共转录由于基因缺失被阻断,但该基因仍可以被分别转录。不同型别的霍乱弧菌和其他弧菌属的菌株tatAtatBtatCtatE单基因和tatABC基因簇聚类分析结果表明,Tat基因簇的种属变异性很小,是一段很保守的序列。

结论

霍乱弧菌ubi aarF基因与Tat基因簇可能共同受调控因子的作用;Tat基因在弧菌属中属于保守结构。

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