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对亚稀褶黑菇和稀褶黑菇的ITS全序列进行了测定和比较，首次报道了亚稀褶黑菇的ITS1和5．8s区域。在ITS区域中，不同采集地的亚稀褶黑菇与稀褶黑菇的5．8S rDNA具有100％的同源性，而两侧ITS之间表现出种内和种间的多态性，种内的差异均不超过5％，种间的差异达10％左右。ITS序列分析方法可以作为两者的鉴定方法。