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目的了解湖南省2005年霍乱疫情分离菌株与常规监测的外环境和水产品中霍乱弧菌分离株之间的遗传相关性，追溯传染源，为预测疫情和制定防治措施提供依据。方法采用PCR检测霍乱菌毒力基因，以脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行菌株的分子分型。结果所有菌株均具有CT基因，20株菌的PFGE为1个型。结论20株霍乱弧菌均是产毒株，具有致病性；湖南省从甲鱼中分离的O139群霍乱弧菌与同期流行的O139群霍乱弧菌分型的带型一致，分子流行病学分析提示甲鱼可能是湖南省近年霍乱疫情主要传染来源之一。