【摘 要】
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OVATE基因家族编码一类广泛存在于植物体内的转录抑制因子,但枣中OVATE基因家族研究未见报道.本研究基于枣全基因组数据鉴定到枣OVATE基因家族15个基因,并对其进行生物信息学
【机 构】
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河北农业大学林学院,保定,071001;河北农业大学园艺学院,保定,071001;河北农业大学生命科学学院,保定,071001;河北农业大学园艺学院,保定,071001;北京林果业生态环境功能提升协同
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OVATE基因家族编码一类广泛存在于植物体内的转录抑制因子,但枣中OVATE基因家族研究未见报道.本研究基于枣全基因组数据鉴定到枣OVATE基因家族15个基因,并对其进行生物信息学分析,发现15个基因非均匀地分布在8条染色体上,各基因长度相差较大,除了 ZjOFP3以外,均不含有内含子结构.各基因共有motif 1保守基序,除ZjOFP15以外都含有motif 1、motif2和motif 3保守基序且顺序相同.系统进化研究发现枣、桃和苹果等6个物种的OVATE基因家族的119条蛋白序列可以分为4个类群,而枣OVATE基因家族分布在各个类群中,进化过程中相对保守.枣OVATE蛋白分别定位细胞外、线粒体、质膜及细胞核上,反映出OVATE基因家族功能的多样性.此外,除了 ZjOFP3、ZjOFP9和ZjOFP15以外,其余皆有着相似的三级结构.顺式作用元件预测发现枣OVATE基因家族与光响应、逆境胁迫、激素诱导、生长发育有关.本研究可为枣OVATE基因家族进一步研究提供参考.
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