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目的 对福氏2a志贺氏菌(Shigella flexneri 2a ,F2a)的志贺氏肠毒素1(Shigella enterotoxin 1,SET1)和志贺氏肠毒素2(Shigella enterotoxin 2,SET2)进行基因分型,提高菌痢暴发流行时同源性分析的水平.方法 对一起暴发F2a菌痢在现场流行病学调查的基础上,用聚合酶链反应(PCR)方法,检测43株F2a菌的志贺氏肠毒素1基因(set 1)和志贺氏肠毒素2基因(set 2),进行基因分型和同源性鉴定.结果 43株F2a菌株分为3种基因型,即1株set 1(-)/set 2(+);3株set 1(+)/set 2(-);39株set 1(+)/set 2(+).结论 本次菌痢暴发是经污染食物传播,暴发事件中夹杂着散发病例,set 1/set 2基因分型对F2a菌痢暴发流行中的同源性鉴定具有重要作用.