江西地区儿童感染的乙型肝炎病毒全基因组序列分析

来源 :南昌大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong428
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目的初步调查江西地区乙肝疫苗免疫儿童感染的乙型肝炎病毒全基因组的分子特征。方法收集江西省儿童医院11 445份乙肝疫苗免疫儿童血清标本,采用酶联免疫吸附试验检测HBV-M,抽提乙肝表面抗原(HBsAg)阳性血清中的HBV DNA,分3个相互重叠片段PCR扩增HBV基因并测序,采用ContigExpress软件对所测序列拼接成全基因组序列,分析各读码框核苷酸和氨基酸变化。对HBV不同基因型以及所获得的HBV全基因组的S基因序列进行系统进化树的构建以确定基因型。结果 11 445份血清样品中,检测出117份HBsAg阳性标本,进行分段重叠扩增并测序,最终拼接出58份完整的HBV基因组,均为B基因型和adw血清型。对各开放读码框进行序列比对发现PreS区存在散在分布的突变:如A2990C→H48P、A2999C→N51T、C3041T→P65L、C3097A→L84I和A3136G→T97A;S区突变集中在120~200aa,主要突变位点为C533A→P127T、A541C→Q129H、G588C→G145A、T753A→F200Y;前C区突变位点有A1814C/T1815C→M1P、G1896A→W28*,C区出现1例C1913A→P5T变异;P区出现散在分布的突变位点,未发现与耐药性有关的突变位点,其RT区YMDD核序也未发生变异;X区氨基端主要突变点为:G1437T/A→G22C/S、G1476A→G35R和G1503A/T/C/T1504G→V44I/F/L/C,羧基端突变集中在120~150aa,出现5例A1762T/G1764A→K130M/V131I突变。结论了解分析儿童HBV全基因组的分子特征和突变情况,为疫苗免疫儿童感染乙肝的预防和治疗提供病毒学分子信息。
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