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对番木瓜基因组DNA的提取及SRAP反应体系的模板、引物、dNTP、Taq聚合酶等条件进行了优化。结果表明,在20μL反应体系中,最优反应体系为模扳DNA 40 ng,引物浓度0.4/,mol/L,Taq聚合酶0.4U/20μL,dNTPs 0.2mmol/L。番木瓜的SRAP-PCR程序为94℃预变性4分钟;94℃变性1分钟。35℃复性1分钟,72℃延伸1.5分钟,5个循环;94℃变性1分钟,52℃复性1分钟,72℃延伸1.5分钟,35个循环;最后72℃延伸10分钟,4℃保存。