广义α转角的预测研究

来源 :华中科技大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiyufeike
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首次尝试对依据α碳之间距离定义的α转角进行预测.该方法使用SVM的对基于757个非同源蛋白质、共5 081个依距离定义的α转角进行训练和测试.并使用7-折交叉验证测试不同输入对预测性能的影响.使用多序列联配信息代替单序列信息作为输入,预测性能得到很大提高.加入二级结构信息,预测性能得到进一步提高.研究表明:综合多序列联配信息和预测的二级结构信息作为输入预测α转角的准确率有较大提高,Matthews相关系数达到0.415.
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