miR-2400在牛各组织中表达及其靶基因预测

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hui8554974
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miRNA作为生物体内的单链非编码小RNA,在调节细胞生长、增殖和分化等生物学过程中的作用,使其受到越来越多的关注.miR-2400是牛中特异表达的miRNA,但其在牛各组织中的表达规律及其可能的靶基因尚不清楚.本研究首先介绍了miR-2400在牛基因组中的位置及序列信息,通过茎环荧光定量PCR技术检测了牛各组织中miR-2400的表达,结果表明,其在皮肤中表达最高,其次是结缔组织和脂肪组织;且在增殖状态的牛骨骼肌卫星细胞中的表达高于分化状态时的表达.miRNA主要是通过其“种子序列”与靶基因mRNA的3'UTR结合从而发挥调控作用.为了更好地了解miR-2400的作用及机制,本研究通过在线软件预测了其可能结合的靶基因,发现大约有544个基因mRNA的3'UTR含有miR-2400潜在的结合位点,大部分靶基因参与细胞的增殖、分化和凋亡.本研究结果为进一步深入研究miR-2400在牛各组织中的作用奠定基础.
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