【摘 要】
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葡甘聚糖是铁皮石斛的标志性成分,它的生物合成主要由CSLA家族基因调控.为了系统评价铁皮石斛CSLA家族成员,通过从NCBI数据库下载铁皮石斛基因组数据,利用生物信息学手段进行
【机 构】
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浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,浙江临安311300
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葡甘聚糖是铁皮石斛的标志性成分,它的生物合成主要由CSLA家族基因调控.为了系统评价铁皮石斛CSLA家族成员,通过从NCBI数据库下载铁皮石斛基因组数据,利用生物信息学手段进行DcCSLA基因家族成员的全基因组鉴定、系统进化、基因结构、蛋白质保守结构域和基序、启动子顺式元件、基因表达对胁迫响应的分析.结果 显示铁皮石斛包含13个CS-LA基因家族成员,均包含9～10个外显子;在进化关系中,CSLA被聚为5组,DcCSLA基因分布于所有分支中,其中group Ⅰ的祖先基因在单双子叶植物分化之前已存在,groupⅡ～V仅在单子叶植物存在,说明group Ⅰ代表最早起源的类群;DcCSLA家族蛋白均含有标志性的CESA_CaSu_A2结构域;它们的启动子区域包含与胁迫和激素相关的顺式调控元件;胁迫处理下,低温诱导DcCSLA5的表达,抑制DcCSLA3的表达;翠雀小核菌侵染抑制DcCSLA3,4,6,8,9,10的表达;茉莉酸处理导致DcCSLA11表达量显著上调,DcCSLA2,5,7,12,13显著下调,表明DcCSLA基因广泛参与生物和非生物胁迫的应答.这些结果为进一步研究铁皮石斛CSLA基因在葡苷聚糖合成积累方面的功能奠定了基础.
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