考虑到建设现代生态农牧区，关键要发挥好政策导向作用，使得功能区的农户和地方政府保护生态有效益、不吃亏，建议进一步从国家层面上统筹设计该区域经济社会发展政策。
　　一是优先把草牧业作为生态区的主导产业。北方农牧交错带是我国旱作农业或雨养农业的主要分布区，牧草植被有着广阔的生态适应性，同时在多年生牧草覆盖下土壤不易侵蚀，对季节性干旱也有一定抵抗能力，在一定程度改善了该区域的生态环境条件。因此，北方农牧交错带要以发展高效草产业、高效低耗饲料业和草食畜牧业为核心，恢复和保护受损草地生态系统，达到生态环境保护与农业生产的协调发展，实现改善生态环境和发展经济的双赢局面。
　　二是加大对生态农牧区利益补偿。北方农牧交错带经济发展水平低，生态环境保护须从实际情况出发，加快建立区域重要农业资源台账制度，对耕地、水、生物等重要农业资源进行调查监测、分析评价。坚持生态效益与经济效益并重的原则，突出农牧交错带生态系统服务价值，建立区域间的生态补偿机制，把生产建设与生态建设相结合，处理好经济发展与生态恢复的关系。
　　三是完善绿色生态导向的产业政策。农牧交错带农村经济基础差，社会经济结构不合理，在该区进行生态环境建设不可避免地会与一些村民的经济发展需求相矛盾，退耕还林还草必然使某些村民的耕地减少；封山育林、草場围栏封育也会影响村民的生活和能源问题。要以人为本，把解决好村民的收入问题放在首位，统筹安排好生态环境建设与经濟建设，制定鼓励发展二三产业的政策，利用财政、信贷等宏观经济手段积极推进农牧交错带产业结构的战略性调整，走出依赖自然资源发展经济的传统路径。