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黄土与第四纪地质国家重点实验室依托中国科学院地球环境研究所建设，其前身为1985年成立的中国科学院西安黄土与第四纪地质研究室，1987年8月，被中国科学院批准为开放实验室；1993年3月，被原国家计委列入“国家重点实验室建没计划”；1995年通过验收，正式成为国家重点实验室；2004年被科技部授予“国家重点实验室计划先进集体”，获金牛奖。实验室自成立以来，连续七次被国家评为“优秀类”实验室。现任实验室主任为金章东研究员，学术委员会主任为周卫健院士。