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为提高复杂区域内风暴潮的预测能力，以上海黄浦江、长江口和沿岸近海为研究对象，构建了基于浅水方程的风暴潮模型。模型运用HLEC格式计算通量，具有高空间分辨率，能够模拟风暴潮、天文潮、洪水等多重因素作用下潮水位过程变化。它采用了非结构的四边形和三角形混合网格，适合应用于跨尺度河渠和河口等区域潮汐交互作用的分析模拟。为了验证模型，开展了0012号派比安台风和0509号麦莎台风影响下的潮汐变化过程计算。结果表明，该模型能够分析天文潮和台风组合作用下的潮水位变化，能够满足风暴潮预报要求。