HBV共价闭合环状DNA Real-time PCR检测方法比较

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lonwang
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目的

比较HBV共价闭合环状DNA(Covalently closed circular DNA, cccDNA) Real-time PCR检测方法。

方法

选择文献中常用的普通Taq-Man探针及Taq-Man MGB探针两种检测方法,合成引物及探针,制备质粒标准品,提取乙肝患者血清及肝组织标本HBV DNA,分别用质粒安全ATP依赖的DNA酶(Plasmid-safe ATP-dependent DNase, PSAD)酶切,进行敏感性、特异性及重复性检测验证。

结果

两种检测方法扩增质粒标准品均有良好线性关系(R2 0.989和0.976),重复性良好(CV<4%);检测PSAD酶切前后质粒、血清及肝组织HBV cccDNA均有良好特异性;检测相同浓度样品时普通Taq-Man探针Ct值较Taq-Man MGB探针略低。

结论

两种方法均可用于HBV cccDNA检测,本实验所用的普通Taq-Man探针较Taq-Man MGB探针敏感性略高;MGB探针本底更低。实际工作中可根据需求选择适宜的探针。

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