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基于协同学理论,构建种业科企合作实现机制的理论研究框架,采用西部6省48个科教单位的433份调查数据,运用Logistic二元选择模型实证分析目前种业科企合作的现状以及合作机制要素对科教单位参与合作的影响程度。并提出完善种业科企合作机制关键在于加强合作的深度,实现合作体内部的制度的明晰以及外部环境的引导与支持。