【摘 要】
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目的基于CMap数据库筛选骨质疏松症(OP)相关基因及潜在治疗药物,为OP的治疗提供新思路。方法检索GEO数据库中关于OP的相关芯片,采用R语言分析差异基因;检索疾病基因公共数据
【基金项目】
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山东省保健科技协会科学技术课题(SDBJKT20170024)
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目的基于CMap数据库筛选骨质疏松症(OP)相关基因及潜在治疗药物,为OP的治疗提供新思路。方法检索GEO数据库中关于OP的相关芯片,采用R语言分析差异基因;检索疾病基因公共数据库,获得已知OP的相关致病基因,通过映射获得OP的致病关键靶点,构建作用靶点的蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络,利用DAVID数据库对关键基因进行GO分析和KEGG通路分析,采用关联性图谱(CMap)数据库筛选出负相关的小分子化合物。结果检索GEO数据库筛选出GSE56116的芯片,利用R语言分析筛选出69个上调基因和10
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