带任意长度通配符的模式匹配

来源 :自动化学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:icqn2007
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基因序列中,许多病毒并不是简单的直接复制自己,而是相邻字符间插入或者删除序列片段,如何从序列数据中检索这些病毒具有重要的研究价值。提出了一个更普遍的问题,带任意长度通配符的模式匹配问题(Pattern matching with arbitrary-length wildcards, PMAW),里模式中不仅可以有多个通配符约束,而且每个通配符的约束可以是两个整数,也可以从整数到无穷大。给定序列S和带通配符的模式P,目标是从S中检索P的所有出现和每一次出现的匹配位置,并且要求任意两次出现不能共享序列中同一
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