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目的：对ICU和呼吸内科下呼吸道感染患者的菌群分布特点和耐药率进行对比研究。方法选取2013年2月—2014年2月我院ICU和呼吸内科收治的下呼吸道感染患者的下呼吸道灌洗液进行进行细菌培养和耐药率的检测，比较两个科室感染下呼吸道的菌群分布特点、优势菌群类型和对常用抗生素的耐药率。结果 ICU患者的菌群中革兰阳性菌、革兰阴性菌和真菌所占的比例分别是62.2%、30.9%和6.9%；呼吸内科患者的菌群中革兰阳性菌、革兰阴性菌和真菌所占的比例分别是55.6%、41.2%和3.2%，两组患者在菌群整体分布上的差异有统计学意义（P<0.05）；在优势菌群上和对常用抗生素的耐药率上，两组患者亦有较明显的差异。结论 ICU和呼吸内科下呼吸道感染患者在菌群分布和对常用抗生素的内要率上存在较明显的差异，弄清这些差异可以为合理应用抗生素，为患者提供更理想的治疗方案提供依据。