静电和疏水效应对SARS冠状病毒3CL蛋白酶二聚体稳定性的影响

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从TGEV 3CL蛋白酶二聚体结构出发,研究了TGEV 3CL蛋白酶二聚体单体之间的静电和疏水相互作用.蛋白质的静电相互作用通过有限差分方法求解Poisson-Boltzmann方程得到,疏水相互作用通过分析溶剂可及性表面模型得到.考察了不同Ph值对SARS 3CL蛋白酶二聚体静电和疏水相互作用的影响,在Ph=5.5~8.5时,二聚体静电相互作用能、静电去溶剂化能和疏水自由能都具有较小的数值,表明在该条件下静电和疏水相互作用有利于二聚体的稳定存在.由于SARS 3CL蛋白酶活性模式为二聚体,因此,在该Ph
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