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目的
运用DNA条形码技术对陕西省境内黑线仓鼠标本进行种别鉴定。
方法在陕西省陕北地区的定边、靖边县和关中地区的大荔县,采集65份黑线仓鼠标本(定边县58份、靖边县2份、大荔县5份),基于线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因进行序列分析,计算遗传距离,邻接法(NJ)构建系统发育树。
结果定边县2份黑线仓鼠样本(13.16、13.21)与定边县其他56份样本的遗传距离为9.2%~10.0%,而56份样本与靖边县黑线仓鼠样本的遗传距离≤1%,与大荔县黑线仓鼠样本的遗传距离为7.2%~8.3%;靖边、大荔县内部样本的遗传距离≤1%。NJ系统树中,3个县黑线仓鼠样本分成两个高置信度的大分支,定边县2份样本(13.16、13.21)聚为一类,其余样本单独成支;定边县其余56份样本与靖边县样本在一个小分支上,大荔样本占据另一小分支。
结论陕西省陕北、关中地区存在3种黑线仓鼠亚种,定边县有两种,大荔县为另一亚种。