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利用21对引物在33个辣椒材料中共检测到54个等位基因，每对SSR引物检测到2-4个等住基因变异，平均为2.6个，说明辣椒种质资源的遗传多样性相对较少。通过MVSP3、13f软件对SSR数据进行聚类分析，把33个辣椒材料分为五类，同个种的辣椒种质资源基本聚在一起，说明用SSR标记采区分辣椒种质是可行的，是研究辣椒种质资源遗传多样性的有效手段。