鲤鱼同源框基因家族HoxA2b基因生物信息学分析

来源 :浙江农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangjunshisb
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Hox基因家族是一组决定胚胎发育的关键基因,也是研究生物进化中染色体加倍和基因复制的重要模型之一。通过利用比较基因组学和生物信息学的方法,对鲤鱼基因组数据库的HoxA2b基因进行调取、序列分析比较,绘制4种同源进化树,结果发现:HoxA2b基因十分保守,大多数鲤科鱼类HoxA2b基因同源性在99%-100%;找到一段所有生物共有的保守序列,长度为188bp,编码62个氨基酸;鲤鱼的HoxA2b基因与其他20种生物的保守区同源性在85%-100%,相对遗传距离在1.14—1.55之间;对碱基替代率进行分析发
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