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随着我国经济的飞速发展,市场经济体系日益完善.我国事业单位在财务管理方面取得的成就,极大地推动了我国经济的快速发展.但是在实际工作过程中仍然存在很多需要改进的地方.本文针对我国迪庆藏区疾控中心基层医疗单位的财务管理内部控制进行详细地研究,并结合迪庆藏区的实际特点,分析存在的问题,同时提出相应的解决办法,进而促进内部控制在事业单位中的应用.