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当前对早期生命演化过程的研究仍存在许多尚未解决的问题,其中以真核生物“基因组起源”和“细胞功能演化”最为重要,回答该问题的关键在于确定真核生物在生命树中的位置以及20亿年前获得线粒体的宿主与现代古菌之间的关系.最新研究认为真核生物是从属于古菌的一支,而新古菌的不断发现将进一步推动“真核细胞功能演化”的研究.文章先对有关“古菌”、“生命树”和“真核细胞功能演化”的研究进展及挑战进行梳理,之后单独总结了当前中国的古菌研究现状,最后从“宏基因组”、“生物信息学方法”和“古菌的分离培养”三方面对通过构建古菌系统发育推动生命演化研究提出展望.