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3免疫性防御机制胃肠道微生物对通过竞争排斥来发育和维持“物理屏障”极为重要,而竞争排斥使得病原微生物不能附着于黏膜内皮细胞上。而且,有益微生物能在黏膜和系统水平上促进免疫机制的发育和有效性。在无菌动物上,所有主要免疫器官都发育不良,直到感染微生物后才会得到充分发育。孵化时鸡肠道的免疫系统是很不成熟的,要想使鸡能列付将在肠道定植的微生物菌群,这一系统就必须非常快速地发挥其功能。