Free energy calculation of single molecular interaction using Jarzynski's identity method: the case

来源 :力学学报:英文版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yiyan3002
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Jarzynski 身份(JI ) 方法被建议为重建的一个有希望的工具在数字模拟和实验的 biomolecular 相互作用的免费精力风景。然而, JI 方法很好还没在象 ligand 受体那样的复杂系统被测试了分子的对。在这份报纸,我们使用了驾驶分子的动力学(SMD ) 的一个巨大的数字分裂的模拟人的免疫不全类型的朊酶我病毒(HIV-1 朊酶) 和它的禁止者。我们证明因为 ligand 受体系统的内在的复杂性,精力障碍由 JI 预言在高拉率的方法比试验性的结果高得多。然而,与更慢的拉,率和少数交换模拟的
其他文献
基于物理力学理论,利用量子力学的IOSA方法和Ar-O2等效势模型计算了Ar在O2气体中的扩散系数和粘滞系数,并将计算值与实验值进行了比较。
用组态相互作用方法,研究了Nb^3+,Na-like 2p^53l3l’,内壳层电子激发跃迁的自电离速率和自电离分支比,结果表明自电离速率对自电离分支比的贡献最大。
在日益全球化和充满流动性的世界当中,传统意义上的罗曼蒂克、完整的“家”已经被更加变动和分裂的“家”所代替。对华人移民而言,“祖先的家”、“情感的家”和“功能的家”构
【正】 关于认识来源的问题,涉及反映论与实践论的关系,认识过程的两个阶段,认识的真理性标准,甚至牵连到整个认识论的结构和体系,因而引起理论界的热烈讨论,这是一件好事,它
目的研究葛根素在肥胖型多囊卵巢综合征(PCOS)治疗过程中的抗氧化应激作用。方法收集30例肥胖型PCOS患者,随机分为肥胖型治疗组15例和肥胖型对照组15例,收集15例瘦型PCOS患者
该文通过对塔里木河中游地区剖面沉积物粒度、14C测年、CaCO3和沉积物特征进行了分析,说明全新世地层中的中、细砂形成与现代流沙经历了相同的发育模式:即冲积砂风蚀形成沙丘砂,以及现代
针对常规SOFM(self-organizing feature map)无监督的神经网络,提出了一种改进的自组织特征映射SOFM神经网络算法。在常规SOFM网络数据聚类算法基础上,分析了其在实际应用q-存在
在扭曲波库仑玻恩交换似近下用编制的计算程序计算了类氢离子He,C,Ne,Si,Ca,Fe的电子碰撞电离截面,并将结果与Younger的扭曲波结果作了比较。在2%以内本文的结果与Younger的结果一致。并详细研究了半经典交换势
这研究处理用机能上地分级的材料(FGM ) 做的环形的旋转磁盘的压力分析。磁盘的弹性模量和密度被假定根据一个幂定律函数放射状地变化,但是材料具有经常的泊松比率。坡度参数
近耦合近似下,采用R-矩阵方法求解耦合的积分微分方程,给出了低能电子与中性锂原子的碰撞激发截面,并与实验数据和其它理论计算数据进行了比较。