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利用SSR标记分析了贵州常用玉米自交系的遗传多样性。从50对引物中筛选到10对核心引物，10对引物在35个供试材料中共检测出75个等位基因位点，每对引物检测出5～14个，平均7．5个，多态性信息量为0．739。35个自交系之间的遗传相异系数变化范围为0．154～0．838，平均为0．513。聚类结果表明，35个自交系划分为7个类群，分类结果与系谱来源基本一致。贵州地方玉米种质被划分到不同类群中去，表明地方玉米种质具有广泛的遗传基础。