青岛市2014年手足口病病原谱及柯萨奇病毒A10、A6型VP1区基因特征

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:BONNIE111
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

阐明青岛地区2014年手足口病(hand, foot and mouth disease,HFMD)病原谱及柯萨奇病毒A10、A6型青岛毒株的基因特征。

方法

用荧光RT-PCR法检测2014年青岛地区HFMD患者咽拭子标本总肠道病毒(EV)、肠道病毒71(enterovirus,EV-A71)型、柯萨奇病毒A16(coxsackievirus,A16,CV-A16)型、柯萨奇病毒A10(coxsackievirus,A 10,CV-A10)型和柯萨奇病毒A6(coxsackievirus,A6, CV-A6)型,半巢式反转录PCR扩增其他型肠道病毒VP1区部分基因序列,结合序列分析鉴定血清型。扩增CV-A10和CV-A6 VP1基因全长序列并测序列测定,以Mega 5.0软件进行遗传进化分析。

结果

2014年共检测HFMD标本1 727例,鉴定出肠道病毒11种,主要病原为EV-A71(38.0%,410/1 078)、CV-A16(28.8%,311/1 078)、CV-A10(14.1%, 152/1 078)和CV-A6(3.2%, 34/1 078)。CV-A10占HFMD病原构成在不同年龄段患儿间存在显著性差异,随年龄增高下降(χ2=15.19,P=0.001),在住院病例病原构成中所占比例显著高于门诊病例(χ2=49.1,P<0.001),且60.0% CV-A10感染的住院病例出现神经系统受损症状。VP1基因遗传进化分析显示,青岛地区2014年CV-A10毒株均属于C基因型,其中71.7%位于C5分支;CV-A6毒株均属于D基因型,其中83.3%位于D5分支。

结论

EV-A71、CV-A16、CV-A10和CV-A6是2014年青岛地区HFMD的主要病原。CV-A10在低龄儿童HFMD病原构成中占比例较高,易引起神经系统损害。C基因型的C5分支毒株是CV-A10主要流行毒株,D基因型的D5分支毒株是2014年青岛CV-A6主要流行毒株。

其他文献
目的探讨CAR-T细胞制备过程中,可能出现的CD19 CAR转染入白血病细胞的免疫表型特征。方法倒置显微镜观察Nalm-6细胞CD19 CAR转染后细胞形态变化;流式细胞仪检测CD19 CAR的转染率和CD19 CAR Nalm-6细胞的免疫表型;化学发光法检测培养体系的细胞因子分泌。结果CD19 CAR Nalm-6转染率为(46.50±3.78)%,CD19 CAR KG1a转染率为(15.7
Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)是目前研究较为深入的TLR,属于Ⅰ型跨膜蛋白,其配体包括革兰阴性菌脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)及其衍生物单磷酰脂A(monophosphoryl lipid A,MPLA)等。TLR4激动剂或单独应用,或作为复合佐剂的主要组分,或与其他TLR激动剂联合使用,已广泛用于多种疫苗的研发,展现良好的应用前景。
目的探讨降钙素基因相关肽(CGRP)对肺炎克雷伯杆菌脂多糖(LPS)诱导炎症反应的影响。方法体外培养肺炎克雷伯杆菌提取其LPS,不同浓度LPS刺激BEAS-2B细胞后,通过免疫荧光法检测细胞内人类β防御素2(hBD-2)的活化情况,并检测不同浓度CGRP处理后细胞内hBD-2的活性;MTT试验以及流式细胞术分别检测LPS刺激以及CGRP共同处理后BEAS-2B细胞的增殖以及凋亡水平;最后以中性粒细
目的探讨HIV派生的MicroRNA99(miRNA99)对巨噬细胞焦亡的影响及机制。方法用佛波酯(PMA)刺激人单核白血病细胞(THP-1)分化成贴壁的巨噬细胞,流式细胞术测定细胞表面CD11b;将鉴定好的细胞分组,分为PBS组(空白对照)、LPS+ATP组(阳性对照)、miRNA99组(实验组);将miRNA99 mimics转染至细胞,采用Western blot(WB)方法测定活化casp
目的探讨使用ETV治疗应答不佳的HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者的基线特征。方法回顾性研究2016年1月至2019年1月在首都医科大学附属北京地坛医院就诊接受恩替卡韦治疗应答不佳的70例患者。随访基线及治疗12周、24周、48周时的HBeAg定量、HBV DNA定量、ALT、TBIL、ALB、Cre水平。根据治疗48周时的HBV DNA是否>3 log10 IU/ml,将70例应答不佳患者分为高应答
目的了解北京市2017—2018监测年度乙型流感病毒Victoria系(BV)血凝素(HA)基因的抗原性及基因特征。方法收集北京市17个流感病原学监测实验室经MDCK细胞培养分离得到的BV流感病毒30株,以WHO推荐的BV流感疫苗株为参考毒株进行抗原性分析;另外,提取BV病毒的总核酸作为模板,进行HA片段全长的RT-PCR扩增和HA基因测序及突变分析。结果30株BV流感毒株的抗原性分析结果:23株
目的了解辽宁省沈阳地区女性人乳头瘤病毒(HPV)感染及型别分布特征。方法采用基因扩增及导流杂交技术对55 548例患者宫颈脱落细胞进行HPV分型检测。结果在55 548例患者中,HPV检测阳性9 566例,阳性率为17.22%,其中高危型HPV感染阳性率为14.57%,单一型HPV感染阳性率为13.63%;共检测出HPV型12 360株,其中高危型10 879株,占88.02%;≤20岁女性常见感
目的分析浙东地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布特点,并探讨其与性别、年龄、病毒载量、抗病毒疗效等的相关性。方法选择2011年1月至2018年4月在宁波市第二医院就诊的HCV感染患者501例,分别采用基因芯片法、RT-PCR法检测HCV基因型和HCV RNA,同时检测肝功能和血常规指标,计算APRI指数,对部分接受聚乙二醇化干扰素联合利巴韦林(PR)标准方案治疗的患者分析获得持续病毒学应答(SVR
目的对安徽蚌埠急性呼吸道感染患者咽拭子样本进行人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)的分离与鉴定。方法选择安徽蚌埠哨点医院诊断为急性上呼吸道感染患者的108份咽拭子标本,提取病毒RNA,采用HRV通用引物进行荧光定量PCR检测。将阳性标本进行病毒分离,对HRV病毒株进行HRV VP1基因的扩增与进化树序列分析。结果荧光定量PCR检测HRV呈阳性标本共5份,标本感染H1-Hela细胞3
目的分析登革病毒(dengue virus,DENV)感染病例各检测指标值的关系,为制定合理的检测策略提供经验。方法以1例急性期2型DENV感染病例为例,分析检测中抗原、抗体及核酸结果之间的联系。结果在NS1抗原初检、IgM和IgG抗体检测皆为阴性情况下,核酸检测出现阳性结果;该病例所感染毒株的NS1编码基因未发生明显变异;而更换另一种NS1抗原试剂进行复检则结果阳性。结论实验室要进行登革病例的排