茶树紫黄素脱环氧化酶基因的cDNA克隆及其生物信息学分析

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根据GenBank中已登录的植物紫黄素脱环氧化酶(VDE)基因序列,以其高度保守的氨基酸序列设计一对简并引物,采用RT-PCR与3′/5′-RACE相结合的方法, 从茶树(Camellia sinensi)中克隆出VDE的全长cDNA,长度为1 632 bp.分析表明,该序列的5′-端和3′-端的非编码序列长度分别为61 bp和140 bp,开放阅读框为1 422 bp,编码473个氨基酸,其转运肽长度为132个氨基酸.成熟蛋白的氨基酸序列与拟南芥、莴苣、菠菜及烟草的同源性分别为83.5%,82.7%,8
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