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腹毛目纤毛虫鬃棘尾虫的纤毛器微管骨架由口围带、波动膜、额腹横尾棘毛、左右缘棘毛和背触毛等纤毛器微管和纤毛器基部附属微管等组成，其中口围带基部含小膜托架、小膜后微管、小膜托架微管及小膜托架间的倒“V”形微管连接；波动膜基部形成微管骨架网；额腹横棘毛和左、右缘棘毛基部含前纵微管束、后纵微管束和横微管束，但不同位置的棘毛基部微管发达程度不一样；背触毛基部以纤毛基体为中心向前、后皮层发出前纵微管和后纵微管，形成背皮层微管网。