【摘 要】
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以黑果枸杞为研究对象,利用RT-PCR方法从黑果枸杞cDNA中克隆一个bHLH的转录因子——LrJAF13,通过生物信息学的分析,发现该基因的全长为1 890 bp,编码624个氨基酸的亲水蛋白,
【机 构】
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青海师范大学生地学院; 青海大学; 青海省作物分子育种重点实验室;
【基金项目】
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青海省应用基础研究项目(2015-ZJ-701);中国科学院西部之光项目共同资助
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以黑果枸杞为研究对象,利用RT-PCR方法从黑果枸杞cDNA中克隆一个bHLH的转录因子——LrJAF13,通过生物信息学的分析,发现该基因的全长为1 890 bp,编码624个氨基酸的亲水蛋白,其分子式是C3012H4843N853O978S24,分子量为6.94 kD,脂肪指数(Aliphatic index)为85.45,等电点pI为5.24,亲水性(Grand average of hydropathicity)为-0.497,不稳定指数(Instability index)为50.13,推断出该基因编码的蛋白位于细胞核中,蛋白质三维结构复杂,包含多个α-螺旋和β-折叠结构,与矮牵牛拟南芥bHLH基因编码的蛋白序列的一致性为88%,进化树的分析表明黑果枸杞的LrJAF13与矮牵牛的bHLH的转录因子petunia_JAF13的亲缘关系比较接近。通过上述分析,为解析黑果枸杞果实中高花青素含量的分子遗传机理、优异资源筛选和新品种选育提供了理论依据。
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