【摘 要】
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为阐明青稞在旱胁迫下基因发生可变剪切的规律,本研究以抗旱的“喜拉16号”和旱敏感的“迪庆黑元桂”为试验材料,分别对对照和21%PEG浓度下处理的样本进行多时间点的全转录组
【机 构】
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省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室,西藏自治区农牧科学院农业研究所,西藏自治区农牧科学院
【基金项目】
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西藏财政专项(XZNKY-2018-C-021).
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为阐明青稞在旱胁迫下基因发生可变剪切的规律,本研究以抗旱的“喜拉16号”和旱敏感的“迪庆黑元桂”为试验材料,分别对对照和21%PEG浓度下处理的样本进行多时间点的全转录组测序。结果表明,利用LeafCutter软件在所有的样品中共检测到了22181个可变剪切事件;通过PCA分析发现,可变剪切具有明显的品种间特异性;另外,通过与抗旱基因数据库比对分析发现,在干旱胁迫处理下2个类型品种间有多个抗旱相关的基因发生了显著的差异可变剪切,分别是HVUL1H16429(AtrbohF)、HVUL1H12808(HAB
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