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为了提高藻种显微图像识别率,提出了一种基于自适应形态学的快速藻种顶刺分割和特征提取方法。该方法引入像素宽度的概念,以藻种目标像素宽度直方图和面积分布图为判别依据,自动判定最佳结构元尺寸,以联合滤波、区域归并等形态学操作分割顶刺区域;最后构造了两类局部生物形态学特征提取参数。实验证明,该算法针对不同甲藻细胞目标可自动计算最佳结构元素大小,具有精度高、速度快的优点,且两类特征提取参数具有视觉不变性。