抑制剂RVX08、SF2535、RVXOH与BRD4蛋白第一结构域结合模式的分子动力学研究

来源 :山东师范大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：Norazhongli

【摘要】

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该工作采用分子动力学模拟和主成分分析等方法研究了抑制剂SF2535、RVX08和RVXOH与BRD4蛋白第一结构域(BRD4-1)的结合对BRD4-1蛋白构象的影响.此外,为进一步研究三个抑制剂与

【作者】

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孙鲁艳苏静闫芳芳刘新国张少龙

【机构】

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山东师范大学物理与电子科学学院

【出处】

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山东师范大学学报:自然科学版

【发表日期】

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2019年1期

【关键词】

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分子动力学模拟 BRD蛋白主成分分析 MM-PBSA MD simulationsbromodomain-containing protein 4princi

【基金项目】

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国家自然科学基金资助项目(11274205,11274206).

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该工作采用分子动力学模拟和主成分分析等方法研究了抑制剂SF2535、RVX08和RVXOH与BRD4蛋白第一结构域(BRD4-1)的结合对BRD4-1蛋白构象的影响.此外,为进一步研究三个抑制剂与BRD4-1蛋白的结合能力,采用分子力学泊松-玻尔兹曼表面积(MM-PBSA)方法计算了抑制剂与BRD4-1蛋白的结合自由能.结果表明SF2535与BRD4-1蛋白的结合能力最强.本研究不仅有助于更好的了解BRD4-1的功能和内在动力学,而且还可为以BRD4-1为靶标的有效抗癌药物的研发提供理论基础.

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