【摘 要】
：
核苷酸结合和寡聚化结构域1 (nucleotide binding and oligomerization domain 1, NOD1)基因在鱼类先天免疫中发挥重要作用。为获得与无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)
【机 构】
：
中国水产科学研究院珠江水产研究所; 农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室; 上海海洋大学水产与生命学院;
【基金项目】
：
现代农业产业技术体系专项资金(CARS-46);广东省科技计划项目(No.2016A020210022)
论文部分内容阅读
核苷酸结合和寡聚化结构域1 (nucleotide binding and oligomerization domain 1, NOD1)基因在鱼类先天免疫中发挥重要作用。为获得与无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)抗性性状相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymophisms, SNPs)标记,本研究克隆了尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)NOD1基因组序列(GenBank No. MF479261),并通过克隆测序或PCR产物直接测序法,从20个亲本家系的39尾尼罗罗非鱼的NOD1基因的测序序列中筛选得到44个SNPs位点。通过SNaPshot分型法对子代中的无乳链球菌敏感群体(susceptible group, SG)(83尾)和抗性群体(resistance group, RG)(83尾)进行分型,并利用Popgen 32软件统计分析NOD1基因各SNPs位点在两个群体的多态性和遗传参数。结果显示,对44个SNPs位点中的24个位点进行了成功分型。24个位点的多态信息含量(polymorphism information content,PIC)介于0.09~0.37,所检测SNPs位点呈现出低度或中度多态。通过SNP位点与无乳链球菌抗性/敏感性状之间的关联分析,发现位点SNP5 (G-2284C)与无乳链球菌易感性状显著相关(P<0.05)、SNP13 (G-8956C)与无乳链球菌抗性性状显著相关(P<0.05),SNP12 (G-8955C)与无乳链球菌抗性/敏感性状均显著相关。利用Haploview 4.2软件分析NOD1基因中的24个SNPs位点所形成的单倍块和连锁不平衡情况,结果显示24个位点可构成5个单倍块和16个单倍型,其中单倍块4中的单倍型H4-2(AC)与尼罗罗非鱼无乳链球菌抗性性状显著相关(P<0.05)。上述结果表明,尼罗罗非鱼NOD1基因的3个SNPs位点SNP5、SNP13和SNP12以及单倍型H4-2(AC)可作为分子标记辅助选育的候选分子标记。该研究可为抗链球菌尼罗罗非鱼新品系的选育提供资料基础。
其他文献
<正>通常来讲,不同的学科对同一问题或同一研究对象的研究是导致交叉学科产生的起点,20世纪50年代以来,大量交叉学科的产生成为了学科发展的一大特点,这不仅表现在自然科学或
目的：观察股骨头坏死采取核磁共振和CT诊断的效果。方法：本次的70例研究对象均选自本院2017年1月～2018年1月期问接收的疑似聪骨头坏死患者，采取随机数字表法，将其分为观察组（n=35）和
合理期待原则因契约自由的实质公平遭到破坏而产生，作为一种新兴的法律解释原则，其在规制保险人滥用优势地位，维护保险消费者的合法权益方面发挥了重要作用。然而合理期待原则在
超燃冲压发动机是以高超声速巡航导弹、高超声速飞机和未来低成本可重复使用天地往返运输系统为应用背景的。以美国为首的各航天大国,都在加紧对其研究,并取得了一些技术突破
目的观察针刺疗法治疗妊娠剧吐的疗效。方法将64例妊娠剧吐患者随机分为西医疗法组和针刺疗法组,每组32例。西医疗法组应用常规补液治疗,针刺疗法组在常规补液基础上给予毫针
慢性乙型肝炎患者常因免疫功能低下、免疫调节功能失调/紊乱,不能有效的清除病毒,致使HBV在体内不断复制,导致病情进展、恶化,因此,在抗病毒治疗慢性乙型肝炎的同时,免疫调节
格列齐特(Gliclazide)是最具代表性的第二代磺酞脉类口服降糖药。本文在前人合成方法基础上寻找一条更适合工业化生产的合成路线。以价格低廉易得的1,2-环戊烷邻二甲酸酐为原
目的探讨沙利度胺联合马法兰+泼尼松化疗方案治疗多发性骨髓瘤(MM)的临床疗效及不良反应。方法选取2008年10月至2013年1月在鄂州市中心医院血液科住院治疗的MM患者55例,按随
目前中国城市住房市场不稳定程度较高,这不仅体现为房价的迅速变化,而且反映在交易量的大幅波动上,后者就是住房流动性的变化。有学者研究指出,以实际交易价格为基础的房价指
病历摘要（一）患者男,30岁。主因“头痛50余d,间断发热7 d”于2009年3月12入院。患者于2009年1月20日玩游戏时突然出现双侧太阳穴持续性胀痛,白天轻、晚上重,无恶心、呕吐、发热