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重庆地区稻田杂草有33种，分属22个科，其中以莎草科和禾本科杂草种类最多。稻田优势杂草与耕地制度及栽培方式密切相关。冬季囤水田以牛毛毡、空心莲子草、异型莎草、野慈姑和浮萍为多；稻一油轮作田以猪殃殃、牛筋草、繁缕、看麦娘为多。根据稻田耕作类型科学施用有针对性的除草剂，并实行年度更换，以减少除草剂残留和杂草抗药性的产生；改进收割机械，加强适宜机收的水稻新品种选育，以减轻机械收获稻谷带来的落粒越年生秧苗防除难题。