SSR-PCR和常规PCR检测不同地区并殖吸虫遗专变异的比较研究

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目的 以SSR-PCR和常规PCR对浙江省和福建省5个不同地区并殖吸虫进行遗传变异检测,比较两者对并殖吸虫的基因水平分类的差异.方法 采用微卫星锚定PCR (SSR-PCR)对基因组DNA进行PCR扩增,扩增产物按Nei的方法计算遗传距离,并应用SPSS软件构建系统进化树;采用常规PCR扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚单位(C()I)及核糖体DNA第二间区(ITS2)的基因序列,测序后用BoiEdit软件分析同源性,用MEGA软件构建种系发生树.结果 不同地区并殖吸虫标本的SSR-PCR产物呈多态性,浙江金华、浙江永嘉、福建周宁与福建平和、福建政和的标本存在明显的差异.前两者的遗传距离最近,为0.3333,浙江金华与福建平和的标本遗传距离最远,为0.8667.常规PCR基因序列分析显示浙江金华、浙江永嘉、福建周宁的标本之间在种系发生树上比较接近,浙江金华和浙江永嘉的标本最为接近.结论 利用SSR-PCR和常规PCR进行并殖吸虫的遗传变异分析结果基本一致.SSR-PCR是一种比常规PCR更方便的并殖吸虫遗传变异研究方法.
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