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目的以深圳市为例对新型冠状病毒肺炎疫情期间市级药物警戒实践及制度建设进行思考。方法对深圳市在疫情防控期间的药物警戒工作实践进行总结,并通过文献研究方法对药物警戒理论内涵、体系构成等进行分析。结果突发公共卫生事件下的药物警戒工作开展需建立更加完善的风险监测、数据共享和利用机制。结论应从国家层面将药物警戒制度建设纳入突发公共卫生技术体系建设总体规划,从拓展数据来源、加强信息化建设、构建数据共享机制、制定有效应急处置预案等方面,提高药品风险监测应急处置能力和药品监管的科学性。