水稻S_5区候选克隆R2I19的筛选及序列信息学分析

来源 :中山大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tianlong3311
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以水稻广亲和品种Cpslo17为材料,构建了一个覆盖9倍核基因组的cosmid文库,其平均插入片段约40kb。以与广亲和位点紧密联锁的单拷贝分子标记BAC23D12的R末端为探针,从cosmid文库中筛选得到一个阳性克隆R2I19(-32kb)。结合S5位点的高密度连锁图和物理图谱,初步确定为S5区侯选克隆。对该克隆的2个TAC亚克隆TRW1510(-15kb)及TRW1517(-15kb)进行了初步的生物信息学分析,证实与已知的水稻基因组序列有很高的同源性,并显示其中可能含有与水稻育性相关的基因。
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