中国瘰螈皮肤转录组测序及活性多肽分析

来源 :安徽农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:maamyaayha
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首次对中国瘰螈皮肤组织进行了转录组测序并分析其活性多肽.提取中国瘰螈皮肤组织总RNA用于构建cDNA文库,采用Illumina HiSeq 4000进行测序.测序数据处理后获得unigene,并对其进行基因注释和生物信息学分析.共组装获得了 74 371个非冗余unigene(平均长度为762bp),其中33 627个unigene在七大功能数据库中得到功能注释,5 137个unigene的注释结果来自两栖类物种,约占注释总数的15%.另外,从转录组数据中识别了一些皮肤活性多肽如胆囊收缩素、防御素、伤口愈合肽、蛋白激酶抑制剂、胸腺素,它们大多数具有皮肤免疫或防御功能,且在其他两栖动物种类中均发现有较高序列相似性的同源多肽.结果为阐明蝾螈皮肤免疫或防御机制提供了前期基础资料.
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