【摘 要】
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针对高维小样本的特点的基因表达谱数据,提出一种基于子模性质的特征基因提取算法。首先根据图论知识将独立的基因属性转换为具有结构信息的邻接图,之后对表征基因关系的邻接
【机 构】
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安徽状元郎电子科技有限公司,安徽大学电子信息工程学院
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针对高维小样本的特点的基因表达谱数据,提出一种基于子模性质的特征基因提取算法。首先根据图论知识将独立的基因属性转换为具有结构信息的邻接图,之后对表征基因关系的邻接矩阵利用子模性质的目标函数进行分析,事先设置特征基因子集的个数K,使用贪心算法通过迭代K个步骤,将每一次选取的特征基因加入到集合S中,作为最终选择的特征基因子集;最后,使用SVM分类器进行分类实验。通过几组公开的基因表达谱数据集的实验结果分析说明了该方法的有效性。
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